先入宫的两个冯氏姊妹，一个因难产而死，一个因身染沉疴而被外放出宫，这使冯太后原本择一而立皇后的打算落空。好在此时博陵长公主的女儿冯媛已经长大，冯媛出身高贵，是册立皇后的最佳人选。因此，就在冯太后去世的前一年，由她再次做主，为孝文帝择立皇后。冯媛就这样被皇家风风光光的迎进皇宫。
可冯媛自恃自己是嫡出之女，血统纯正；打心眼里看不起自己庶出的姐姐。如果说冯姗的性情是雅致好静、冯妙莲的性情是妩媚轻佻的话，那么，冯媛的性情就是冷艳傲慢。“贞谨有德操”。她不会也不屑使出狐媚手段去迎合和趋奉皇上，猎获皇上的欢心。这使孝文帝对她又爱又敬，而敬多于爱，这种敬爱之情渐渐导致孝文帝对她有所疏远。这也使孝文帝情不自禁的想起她的异母姐姐冯妙莲来，她温柔的衷肠，她迷人的风姿，她对自己情意绵绵地关怀和慰藉。在这样的现实与心理的对比之下，他偶尔也会派遣宫中宦竖，到庙里去探望和慰问冯妙莲。
虽然冯媛缺乏女性的温柔，毫无风情可言，但她对宫中大小事体，处理得中规中距，也有政治见解，很得冯太后欢心，常夸赞道：侄女随姑。认为冯媛深得自己的真传，将来必能承继衣钵，续振家声。因此，就在她于490年临终之时，她遗言孝文帝，在他亲政之后，一定要册立冯媛为皇后。孝文帝为人谨孝，守孝三年后，遂于太和十七年（493年），册立冯媛为皇后。
之后，孝文帝打听到冯妙莲已经康复，“素疹痊除”，就派遣宦官双二念持书去慰问，并将她再次迎进皇宫，册封为左昭仪。
从此，后宫不平静了，姊妹俩开始争宠了。
虽然冯媛性格持重，本性不妒，有冰雪节操，但在男女情事上，不如冯妙莲会媚人，善媚人，孝文帝在她面前，情趣全无。而冯妙莲不似她那样，心底如玉，洁净无瑕。冯昭仪“有姿媚，偏见宠幸”。她所暗通的高菩萨，为她研制了一种媚药——“肌香丸”。只要将“肌香丸”放在肚脐眼中，一晚上都会通体喷香，经久不散；男子为这香气诱惑，往往爱欲大盛，整夜颠鸾倒凤，都不知疲倦。而这媚药的最大缺陷，就是用后不能怀孕。所以，冯妙莲虽得专宠，却始终无子。
冯妙莲也很有手腕，为了能登上皇后宝座，她积极在宫中活动，以小恩小惠的手段或借助孝文帝的名号，狐假虎威，逐渐使一批宦官和大臣聚集到了自己身边，为她摇旗呐喊。其中有一个叫双蒙的宦官，是她的贴身随扈，他很能揣度冯妙莲的心思，主动做她的马前卒。出面结好皇后冯媛身边的太监王充，随时打听和掌握皇后的行踪。皇后偶有闺中之怨，都会被冯妙莲窥测得明白。
冯妙莲常趁与拓跋宏同床共枕之时，诋毁自己的妹妹，添油加醋地制造是非和流言。史载：“昭仪自以年长，且前入宫掖，素见待念，轻后而不率妾礼”。冯媛虽以忠厚待人，但冯昭仪这样欺辱妹妹。致使素不妒忌的冯媛，也忍不住“有愧恨之色”。冯媛便令太监王充，于某一天，拿着皇后金牌，召冯妙莲按宫中礼仪前来参拜。冯妙莲不得不依礼前去参拜，但自此内心衔恨不已。
枕席之言最能改变人的观点，虽然这床头风看似无形，却有比刀子还闪光的锋芒。尤其在孝文帝迁都洛阳后，主张全盘汉化，比冯太后的改革更加彻底和深入。冯媛颇不以为然，在后宫加以抵制，坚持不穿汉服，不说中原正音，也就是当时的汉语普通话，孝文帝对她渐有微言。于是，冯妙莲便借机百般诋毁她，“昭仪规为内主，谮构百端”。孝文帝遂于太和二十年（公元496年）7月，在大殿之上逼迫冯媛交出皇后玺绶，废为庶人，迫令到瑶光寺出家为尼。几年后又被赐死，年约25岁。史称废皇后冯氏。
冯妙莲如此不择手段，逼走妹妹，目的是要得到孝文帝的专宠。果然，孝文帝对她“宠爱过初，专寝当夕，宫人稀复进见”（《魏书》卷13）。
其他嫔妃从此就很难见到皇帝了。
就在皇后冯媛被废不久，北魏宫中又发生了一件大事。原来被赐死的林夫人的儿子、太子拓跋洵（时年15岁），因与反对迁都的鲜卑大贵族穆泰有联系，图谋在北魏故都平城另立中央，事情败露后，拓跋洵被孝文帝废为庶人，旋赐死。另改立高夫人所生的儿子拓跋恪为太子。
拓跋恪被立为太子后，孝文帝不但不杀太子母，反而以汉族成例，母以子贵。当时拓跋恪的母亲高夫人正在代北。代北是鲜卑拓跋部族逐鹿中原的根据地，孝文帝拓跋宏迁都洛阳时，命令遣散嫔妃，这些人主要就安置在代北和平城。而今拓跋恪被立为太子，拓跋宏遂下旨派人前往代北，迎接高夫人入居洛阳。今皇后位虚，高夫人极有可能就是皇后的不二人选了。
冯妙莲千辛万苦，扳倒了自己的皇后妹妹，眼看皇后之位就要唾手可得。如今却横生枝节，到手的好事就要告吹，她岂能擅自收手？
她于是和自己的心腹双蒙商量，双蒙遂挑选了几名大内高手，偷偷潜出皇宫，埋伏在太行山麓汲郡的一条山道上。待护送高夫人的一队人马到达预定地点后，双蒙及其几名杀手突然窜出，还没等侍卫反应过来，就都一个个身手易地了，轿内的高夫人也被乱刀刺死。
消息传来，孝文帝震怒异常，责令地方官缉拿凶手。地方官查来查去，终无头绪。就捕获了几个劫道的蟊贼，屈打成招，上报结案了。
冯妙莲也假装悲痛，上书孝文帝，自请抚养太子。孝文帝当然没有想到这是冯妙莲的阴谋，就同意了她的请求。这样，冯妙莲顺理成章成为皇后，就是时间早晚的事了。
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